条例明确规定：水资源保护和管理工作实行行政首长负责制。全面推行河长制，建立健全省、市、县、乡河长责任体系，加强水资源保护的组织协调和监督，构建责任明确、协调有序、监管严格、保护有力的水资源保护和管理机制，实行水资源保护和管理责任审计、考核制度。

　　除全面推行河长制，条例还建立和实行最严格的水资源管理制度，建立用水总量控制、用水效率控制、水功能区限制纳污控制等“三条红线”管理制度，规定发现重点污染物排放总量超过控制指标的，或者水功能区的水质未达到水域使用功能对水质要求的，当地政府以及有关部门应当采取治理措施，并停止审批该水功能区新增的取水口、排污口以及排放相应污染物的建设项目；用水总量已达到或者超过用水总量控制指标的地区，有关部门应当停止审批新增取水的建设项目。